虽则大大都球菌性眼结膜发炎（bacterialconjunctivitis）的病例是自限的，可是应用抗菌滴眼液或眼膏是患上当的疗治办法。如果用药后反映很差，就表白有多是病毒性或过敏性眼结膜发炎。对淋球菌性眼结膜发炎应当接纳全身及眼局部抗菌药物来疗治。
衣原体传染会导致致盲性沙眼和包涵体性眼结膜发炎。对衣原体传染的疗治除开注意小我私人卫生和环境卫生以外，主如果抗菌药物的疗治。急性期或严重的沙眼应当接纳口服阿奇霉素（azithromycin）进行全身疗治，初次500mg口服，往后一日250mg,共四日为一疗程。为了保证患者的依从性,也能够接纳单次口服，剂量为1g.眼局部疗治可以滴用抗菌滴眼液或眼膏，如0.3氧氟沙星、0.25氯霉素滴眼液、红霉素眼膏、金霉素眼膏等，以及0.1平滴眼液.
对球菌性角膜溃疡（bacterialcornealulcer）和角膜炎（keratitis）患者，需要由眼科专科医师进行疗治。如果病情严重，可以将这种患者收住进入医院，进行增强疗治。
球菌性眼内炎（bacterialendophthalmitis）是一种医学急病，一样需要眼科专科医生进行处理，凡是需要接纳多种途径，如结膜下打针、前房内打针、玻璃腔体内打针及全身途径来给予抗菌药物。其中以玻璃腔体内打针最为重要，若是眼科切除缝合后导致的球菌性眼内炎，可以向眼内灌注万古霉素1mg/0.1ml或头孢他啶2.25mg/0.1ml,2~3日后反复打针。
有多种药物可以用于眼局部抗传染疗治。左氧氟沙星是氧氟沙星的左旋体，其抗菌活性约为氧氟沙星的2倍，具备抗菌谱广、效用强的独特之处。本品是用于疗治眼部浅层传染的可供选择的药物。滴用左氧氟沙星滴眼液后有大好的耐受性。本品的滴眼液和眼用凝胶均不宜持久使用，以避免诱发耐药菌或真菌传染。
氯霉素滴眼液具备广谱抗菌活性，也是疗治眼表浅层传染的可供选择的药物。滴用本品后耐受性杰出。因为滴用氯霉素滴眼液后存在不容易发明的再生停滞性血虚的危害，是以在临床中应当慎用。
其它具备广谱抗菌活性的抗菌药包孕氟喹诺酮类药物，如诺氟沙星、环丙沙星、氧氟沙星，氨基糖苷类药物，如妥布霉素、庆大霉素、新霉素等。妥布霉素、庆大霉素、环丙沙星、左氧氟沙星、氧氟沙星和多寄生菌素B对铜锈假单胞菌导致的传染有效。夫西地酸在疗治蒲萄球菌传染时是有效的。
氟喹诺酮类药对婴小儿童的安全性尚未确定，有可能会对脆骨发育有影响，是以对18岁以儿童不推荐使用，妊娠及哺乳期裙钗慎用。
抗菌药物与糖皮质激素归并使用许多抗菌制剂中加入糖皮质激素。虽则这种制剂具备抗菌、抗炎、加速治愈历程的长处，但有诱发真菌或病毒传染、延缓创伤弥合、升法眼压和导致晶状体混浊等危害，是以不该当随意使用，错非患者是在眼科专科医师的紧密感情好监护下。出格是不能给尚未诊断确实的"红眼"患者写出这种药物，因为这种环境有时候是因难为以诊断的纯真性疱疹病毒传染所致。如果使用这种制剂，不该当跨越10日，并在使历时期应当按期丈量眼压。
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